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Premio Nobel de Fisiología o Medicina de 1987 — Donégan: el secreto de la combinación para generar 1000 millones de anticuerpos a partir de 1000 genes.

Sistema de generación de código combinatorio del sistema inmunitario, que produce mil millones de anticuerpos mediante la recombinación aleatoria de más de 1,000 fragmentos génicos. El mecanismo genético de la diversidad de anticuerpos que Tonegawa reveló mediante enzimas de restricción y tecnología de recombinación de ADN. El origen del diseño actual de CAR-T, bibliotecas de anticuerpos y vacunas.

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Premio Nobel de Fisiología o Medicina de 1987 — Tonegawa: el secreto combinatorio para generar mil millones de anticuerpos con 1.000 genes

Lo que aprenderá al leer este artículo

Comprenderá la respuesta a cómo nuestro cuerpo puede producir anticuerpos precisos incluso contra antígenos que encuentra por primera vez. Susumu Tonegawa reveló el mecanismo genético mediante el cual los linfocitos B pueden generar casi mil millones de tipos de anticuerpos utilizando solo unas 1.000 piezas de genes. La respuesta radica en que los genes se cortan y se recombinan, un descubrimiento que desafió directamente la creencia académica de la época, que sostenía que "la estructura genética es estable". Exploraremos el linaje que surgió de este descubrimiento y que constituye la base de las actuales terapias con células CAR-T, bibliotecas de anticuerpos mediante phage display, diseño de vacunas y diagnóstico de enfermedades autoinmunes.


Una historia que desafía el sentido común: los genes pueden recombinarse

Imaginemos el desafío que enfrenta nuestro sistema inmunitario. El número de tipos de patógenos y sustancias extrañas que un ser humano puede encontrar a lo largo de su vida es, en la práctica, infinito. Bacterias, virus, hongos, parásitos, productos químicos industriales, nuevos antígenos de vacunas... cada año aparecen nuevas enfermedades infecciosas. Sin embargo, nuestro sistema inmunitario produce anticuerpos que se unen con precisión a los antígenos que encuentra por primera vez en cuestión de semanas, como si hubiera anticipado de antemano a todos los posibles invasores del mundo.

Aquí surge un problema de cálculo. El genoma humano contiene aproximadamente 20.000 genes. Si asumimos que cada molécula de anticuerpo corresponde a un solo gen, el número máximo de tipos de anticuerpos que los humanos podrían producir sería de unos 20.000. Sin embargo, en realidad, nuestro sistema inmunitario puede generar casi mil millones de anticuerpos diferentes. ¿Cómo es posible esta explosión combinatoria?

Hasta mediados de la década de 1970, la comunidad académica debatía diversas hipótesis sobre este problema. Una de las hipótesis más prominentes era que cada célula B poseía un conjunto de genes diferente. No obstante, esta idea entraba en conflicto directo con un principio fundamental de la genética: todas las células somáticas poseen los mismos genes.

La respuesta revelada por Tonegawa es dramática. Los linfocitos B cortan y recombinan sus propios genes durante el proceso de maduración. Los genes de los anticuerpos están divididos en varios segmentos (segmentos V, D y J); al seleccionar aleatoriamente uno de cada segmento y unirlos, se crea el gen del anticuerpo completo. El número de combinaciones alcanza los millones, y la adición o eliminación aleatoria de algunos nucleótidos en los puntos de recombinación genera una diversidad adicional. Finalmente, esto hace posible la existencia de 1.000 millones de tipos de anticuerpos.

En lenguaje de CS, este es un ejemplo perfecto de generación de código en tiempo de compilación (compile-time code generation) o metaprogramación de plantillas. Se dispone de bibliotecas del segmento V (aprox. 40), del segmento D (aprox. 25) y del segmento J (aprox. 6); cuando una célula B madura, selecciona una de cada biblioteca para combinarlas y generar la función completa (anticuerpo).

Matemáticamente, 40 × 25 × 6 = 6.000 combinaciones (para la cadena pesada). Al sumar las combinaciones de la cadena ligera, la inserción aleatoria de nucleótidos en la región de unión y la posterior hipermutación somática (somatic hypermutation), el número de tipos de anticuerpos posibles supera con creces los mil millones. Generación combinatoria de funciones casi infinitas a partir de un código finito.

La importancia de este descubrimiento radica en que transformó los conceptos fundamentales de la genética. Si McClintock (Premio Nobel 1983) demostró la movilidad génica mediante transposones, Donegawa demostró que durante el proceso de desarrollo normal, células específicas recombinan sus propios genes de manera programada.


Paisaje de la época: el año decisivo para la democratización de Corea y el inicio del fin de la Guerra Fría

1987 es uno de los años más decisivos en la historia moderna de Corea.

El 14 de enero, Park Jong-chul, estudiante de la Universidad Nacional de Seúl, muere tras ser sometido a tortura con agua en la oficina de seguridad de Namyeong. El intento inicial de encubrimiento policial —"le di un golpe y murió de repente"— se convirtió en un trágico símbolo de la época. Tras revelarse la verdad, la opinión pública estalló. Cuando el presidente Chun Doo-hwan rechazó las demandas de reforma constitucional mediante la medida de defensa de la constitución del 13 de abril (4·13), la Lucha Democrática de Junio estalló, comenzando con la Gran Asamblea Nacional el 10 de junio.

El 9 de junio, Lee Han-yeol, estudiante de la Universidad Yonsei, queda en estado de muerte cerebral tras ser alcanzado por una granada lacrimógena (fallece el 5 de julio), y esta imagen se difundió por todo el mundo, convirtiéndose en el símbolo de la resistencia. 1,3 millones de personas participaron en la Gran Marcha Pacífica Nacional el 26 de junio. El 29 de junio, el candidato presidencial del partido gobernante, Roh Tae-woo, realizó la Declaración del 29 de junio, cuyo eje central fue la aceptación de la reforma para la elección directa, marcando el fin de facto de 30 años de dictadura militar. Aunque Roh Tae-woo fue elegido en las elecciones de diciembre debido a la división de la oposición, la recuperación real de la democracia coreana se produjo en este año.

El mismo año, el 29 de noviembre, el vuelo 858 de Korean Air explotó en el aire sobre el Océano Índico, con la muerte de los 115 pasajeros y tripulantes. El atentado con bomba fue perpetrado por los agentes norcoreanos Kim Hyun-hee y Kim Seung-il. Al descubrirse que el objetivo era sabotear los Juegos Olímpicos de Seúl 88, la presión internacional sobre Corea del Norte se intensificó.

El Tratado INF entre EE. UU. y la URSS del 8 de diciembre en la política internacional — Reagan y Gorbachov lo firmaron en Washington. Eliminación total de misiles nucleares de alcance medio e intermedio. Un hito decisivo para el fin de la Guerra Fría. Por otro lado, el 19 de octubre, el Lunes Negro de Nueva York — el Dow Jones cayó un 22,6 % en un solo día, exponiendo la vulnerabilidad de los mercados financieros mundiales. Lanzamiento del IBM PS/2 y publicación de "Breve historia del tiempo" de Stephen Hawking (en marzo).

En este año convulso, el Comité Nobel reconoció a la persona que había revelado el mecanismo de generación de código combinatorio en el sistema inmunitario. En el mismo año en que Corea estaba reconfigurando su sistema democrático, se reconoció el descubrimiento de que nuestro sistema inmunitario recombina genes para crear una biblioteca de defensa.


Susumu Tonegawa — De Nagoya al MIT

Susumu Tonegawa (1939– ) es un genetista estadounidense de origen japonés. Nacido en Nagoya, Japón, en 1939, se graduó en química por la Universidad de Kioto y obtuvo su doctorado en 1969 en la Universidad de California en San Diego (UCSD). Posteriormente, trabajó como investigador desde 1971 en el Instituto de Inmunología de Basilea (Basel Institute for Immunology) en Suiza — el instituto fundado por el Nobel de 1984, Jerne. Desde 1981, como profesor en el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT), expandió su eje de investigación hacia la neurociencia cognitiva.

La labor de Tonegawa que le valió el Nobel se realizó durante su etapa en el Instituto de Basilea (1971–1981). En aquel entonces, estaba inmerso en el enigma de la diversidad de anticuerpos, justo cuando las técnicas de recombinación de ADN y las enzimas de restricción —los descubrimientos de Smith, Nathans y Arber (Nobel 1978)— se habían consolidado como herramientas maduras. Fue el caso de un investigador que poseía las herramientas adecuadas en el momento preciso para abordar el problema correcto.


El experimento decisivo — Comparación del ADN de células embrionarias y células B maduras

El diseño experimental de Tonegawa era claro. Si se comparaba el ADN de células embrionarias (células que aún no producen anticuerpos) con el ADN de células B maduras (que producen anticuerpos) tras cortarlos con enzimas de restricción, los patrones de ADN de ambos tipos de células deberían ser distintos si existiera una recombinación génica.

El método utilizado fue la técnica de Southern blot. Se separaron los fragmentos de ADN cortados por enzimas de restricción mediante electroforesis en gel y se detectaron regiones génicas específicas con sondas radiactivas para verificar si los patrones de bandas del gen del anticuerpo diferían entre ambos tipos de células.

El resultado fue dramático. En las células embrionarias, los fragmentos del gen del anticuerpo (V, J) aparecían en varias bandas dispersas, pero en las células B maduras se observó que estos fragmentos se habían unido en una sola banda. Es decir, se constató que físicamente había ocurrido una recombinación de ADN durante el proceso de maduración.

Posteriormente, un análisis genético detallado revela que la cadena pesada del anticuerpo se forma mediante la combinación de cuatro segmentos: V (variable) - D (diversidad) - J (unión) - C (constante), mientras que la cadena ligera se forma mediante la combinación de tres segmentos: V - J - C. De cada biblioteca de segmentos, se selecciona aleatoriamente uno de cada tipo → se combinan → y se completa el gen del anticuerpo.

Se descubre que esta recombinación es un proceso en el que dos proteínas llamadas RAG1 y RAG2 cortan y unen secuencias de reconocimiento específicas (RSS, recombination signal sequences). El hecho de que RAG1/RAG tipo RAG2 hayan evolucionado a partir de enzimas de la familia de los transposones —y que el descubrimiento de McClintock y el de Tonegawa estén conectados evolutivamente— se convierte posteriormente en uno de los mayores hitos de la belleza de la genética.


Marco CS: Generación de código combinatorio y compilación de bibliotecas

Si reconstruimos el sistema de diversidad de anticuerpos en términos de las ciencias de la computación (CS), obtenemos la siguiente representación:

Biblioteca de segmentos: Los fragmentos V·D·J se almacenan en el genoma como una biblioteca de fragmentos de código fuente (snippets). Cada fragmento se encarga de una parte de la función: V constituye la mayor parte del sitio de unión al antígeno, J finaliza el sitio de unión y D introduce diversidad intermedia.

Generación de código en tiempo de compilación: Cuando las células B maduran, las enzimas RAG1/RAG2 actúan como un compilador. Seleccionan aleatoriamente un fragmento de la biblioteca y lo unen físicamente; esto constituye una recombinación a nivel de código fuente. La función completa (el gen del anticuerpo) es una herramienta especializada que solo se expresa en esa célula.

Explosión combinatoria: 40 V × 25 D × 6 J = 6.000 combinaciones de cadena pesada. Al multiplicar por las cadenas ligeras, el número es aún mayor. Si se añade la diversidad de unión (adición de regiones N, nucleótidos P), puede expandirse hasta 101110^{11}.

Sitios variables vs. sitios constantes: Los anticuerpos se dividen en regiones V (variables) y regiones C (constantes). V es código personalizado (especificidad del objetivo), mientras que C es una biblioteca estándar (función efectora). Al combinar diferentes regiones C con la misma especificidad de objetivo, la función efectora del anticuerpo cambia de IgM a IgG o a IgA. Esto es muy similar a la aplicación parcial (partial application) en programación funcional.

Hipermutación somática = ajuste fino en tiempo de ejecución: Incluso después de la recombinación inicial, las células B activadas acumulan mutaciones puntuales en el gen del anticuerpo (mediadas por la desaminasa inducida por activación, AID). Esto se selecciona en la dirección de aumentar la afinidad de unión al antígeno, similar a un algoritmo de aprendizaje que se ajusta finamente (fine-tuning) en tiempo de ejecución.

Hibridomas vs. bibliotecas recombinantes: La tecnología de hibridomas, galardonada con el Premio Nobel en 1984, es un método para producir grandes cantidades de anticuerpos específicos. Tras los descubrimientos de Tonegawa, se desarrolló la tecnología de bibliotecas de anticuerpos mediante phage display (desde la década de 1990), que permite recombinar genes de forma aleatoria en el laboratorio para el cribado de los anticuerpos deseados. Las bibliotecas de fagos reproducen a escala de laboratorio la explosión combinatoria del sistema inmunitario natural.

Esta analogía no es del todo precisa. La recombinación intracelular es estocástica, posee una direccionalidad controlada y cuenta con mecanismos de seguridad que provocan la muerte celular si se producen errores. Es mucho más sofisticada que una simple combinación aleatoria.


Impacto académico: comprensión de la autoinmunidad, la inmunodeficiencia y la terapia dirigida

Tras el descubrimiento de Tonegawa, la comprensión de la inmunología se redefinió fundamentalmente.

Comprensión de la inmunodeficiencia combinada grave (SCID): Si existe un defecto en los genes RAG1/RAG2, no se produce la recombinación de anticuerpos ni la de los receptores de células T, lo que provoca una inmunodeficiencia grave. El caso de David Vetter, conocido como el "niño burbuja", pertenece a este tipo. Posteriormente, la terapia génica abrió la posibilidad de tratar la SCID.

Comprensión de las enfermedades autoinmunes: Durante el proceso de recombinación pueden generarse anticuerpos que reconocen antígenos propios; existen mecanismos de tolerancia central y periférica para eliminarlos. Si esta tolerancia falla, se desarrollan enfermedades autoinmunes como la artritis reumatoide, el lupus o la esclerosis múltiple.

Diagnóstico de linfomas: Los linfomas caracterizados por la proliferación excesiva de un clon específico de células B se diagnostican mediante la detección de la clonalidad de los genes de anticuerpos recombinados. El análisis del reordenamiento de genes de inmunoglobulinas es una herramienta diagnóstica estándar en patología clínica.

Terapia con células CAR-T: Es la aplicación máxima del descubrimiento de Tonegawa. Consiste en extraer las células T del paciente, modificarlas para que expresen receptos de células T con especificidad de anticuerpo y reinfundirlas. Las terapias con células CAR-T aprobadas por la FDA, como Kymriah (2017) y Yescarta (2017), son el estándar en el tratamiento del linfoma de células B dirigido a CD19.

Tecnología de bibliotecas de anticuerpos: La tecnología de phage display (Gregory Winter, Premio Nobel de Química 2018) permite crear anticuerpos completamente humanos en el laboratorio, más allá del sistema inmunitario natural. Adalimumab (Humira) y trastuzumab forman parte de este linaje tecnológico.

Diversidad de los receptores de células T (TCR): El principio del descubrimiento de Tonegawa se aplica de la misma manera a los receptores de células T. La recombinación del TCR, la diversidad del TCR y el análisis de la espectratía del TCR son herramientas estándar en inmunología.


Continuidad en Corea y en la actualidad

El impacto de este linaje en Corea es muy evidente. Desde finales de la década de 1990, los laboratorios de inmunología de la Universidad Nacional de Seúl, Yonsei y KAIST han realizado investigaciones activas sobre la recombinación V(D)J, el análisis de la diversidad del TCR y la genética de las enfermedades autoinmunes.

Introducción de la terapia de células CAR-T en el Hospital de la Universidad Nacional de Seúl — Introducción de Kymriah en Corea en 2021, estándar para el tratamiento de la leucemia linfoblástica aguda pediátrica y el linfoma difuso de células B recurrente. También se han introducido secuencialmente en Asan Medical Center, Samsung Medical Center y Yonsei Severance, por lo que hoy los resultados del tratamiento CAR-T en Corea se encuentran en el nivel más alto del mundo.

Las raíces de la industria de anticuerpos nacional también se encuentran aquí. La tecnología de producción de biosimilares de anticuerpos de Celltrion y Samsung Bioepis es la combinación de la tecnología de hibridoma (Premio Nobel 1984) y la tecnología de librerías de anticuerpos recombinantes (basada en el descubrimiento de Donegawa). En los grandes laboratorios de patología clínica nacionales, el ensayo de reordenamiento genético de inmunoglobulinas para el diagnóstico de linfomas y leucemias está estandarizado.


Por qué es importante

Lo que dejó Donegawa fue el establecimiento de que "el genoma no es estático; ciertas células están programadas para recombinar sus propios genes".

El principio de que se puede crear una diversidad cercana a lo infinito con un código finito es la belleza misma del diseño de sistemas. La naturaleza descubrió la explosión combinatoria de forma evolutiva, y el ser humano, tras comprenderla, la reproduce en el laboratorio mediante técnicas como el phage display o CAR-T. Es un ejemplo representativo de cómo la tecnología humana aprende de los algoritmos de la naturaleza.

El encuentro entre la época y las herramientas también es un símbolo de este premio. Donegawa abordó el antiguo problema de la diversidad de anticuerpos en un momento en que las enzimas de restricción (Premio Nobel 1978) y la tecnología de recombinación de ADN estaban maduras. Es un ejemplo de lo poderosa que es la unión de herramientas maduras con preguntas claras.

La trayectoria de un científico de origen japonés que se extendió desde laboratorios europeos hasta el MIT en Estados Unidos simboliza la propia internacionalidad de la ciencia de finales del siglo XX. Su trayectoria vital, comenzando en Nagoya y pasando por UCSD, Basilea y el MIT, contiene la propia universalidad de la academia.


Tras este premio, el flujo de la inmunología y la genética continúa con lo siguiente:

  • 1990 Phage Display — Gregory Winter et al., posteriormente Premio Nobel de Química 2018
  • 1996 Doherty y Zinkernagel — Restricción por MHC de la inmunidad celular
  • 2011 Buttler, Hoffman y Steinman — Inmunidad natural y células dendríticas la
  • 2018 Allison y Honjo — Inhibidores de puntos de control inmunitario CTLA-4 y PD-1

Aplicaciones clínicas e industriales de estos descubrimientos:

  • Terapia de células CAR-T — Kymriah (2017) · Yescarta (2017)
  • Phage display de anticuerpos totalmente humanos — Adalimumab (Humira 2002)
  • Ensayos genéticos inmunológicos — Estándar de diagnóstico de linfoma y leucemia
  • Librerías de receptores de células T — Terapia de células TCR-T
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