SKAT — 希少変異を個別に検出しない理由
なぜ重要なのか
希少変異は個々の観察数が少ないため、遺伝子（gene）や領域（region）単位でグループ化して検定を行う。Burden test は含まれる変異の効果が同方向であることを仮定しており、この条件下では高い検出力を持つ。一方、SKAT は効果の方向や大きさが異なる場合や、因果関係のない変異が混在する集合に対してより柔軟に対応できる。SKAT-O はこれらの二つの極端なアプローチを組み合わせたものだが、自動的に正解を与えるわけではない。結果に影響を与える要因として、バリアントセット（variant set）、重み付け（weight）、MAF 閾値、表現型モデル、祖先・血縁関係、および多重検定補正計画が含まれる。有意なセットが検出されたとしても、それがどの変異を因果的とするものなのか、あるいは臨床的に重要であるのかを直接的に示すものではない。
解釈の境界
本稿は概念と根拠の範囲を説明するものであり、個々の患者に対する診断・検査・治療の判断を提示するものではありません。