AlphaFold — 予測構造の信頼性をどう読むか
なぜ重要なのか
AlphaFoldの3次元座標はモデルによる予測値です。AF2、AF-Multimer、AF3では、予測対象やバージョンが異なります。pLDDTは残基周辺の局所的な信頼度を、PAEは残基間・ドメイン間の相対的な配置の不確実性を把握するのに役立ちます。高い信頼度であっても、細胞内環境、動的挙動、代替状態、結合親和性、あるいは生物学的機能などを自動的に証明するものではありません。予測結果は変異設計や実験仮説の起点として活用し、実験的に決定された構造や生化学的・細胞レベルのエビデンスと照合して検証します。
解釈の境界
本稿は概念と根拠の範囲を説明するものであり、個々の患者に対する診断・検査・治療の判断を提示するものではありません。