Medicina de precisión en el Reino Unido: distinguir cohortes, proyectos y servicios sanitarios
¿Por qué es importante saberlo?
La medicina genómica del Reino Unido suele presentarse conjuntamente bajo los nombres de UK Biobank, 100,000 Genomes Project y NHS Genomic Medicine Service. Aunque han influido mutuamente en la generación de datos y el desarrollo de recursos humanos y tecnológicos, son sistemas con propósitos distintos, participantes diferentes y acuerdos distintos sobre la devolución de resultados. Agruparlos bajo un único "proyecto genómico británico" conduce a confundir las cohortes de investigación con los servicios reales de atención clínica.
El éxito de un ecosistema a nivel nacional no puede evaluarse únicamente por el número de genomas secuenciados. Deben funcionar conjuntamente la calidad del fenotipo, el flujo hacia el diagnóstico, el consentimiento y el acceso a los datos, la representatividad y la integración en la práctica médica.
UK Biobank: cohorte de investigación
UK Biobank es un recurso de investigación prospectivo que vincula información genética, pruebas, imágenes y registros de salud a largo plazo de muchos participantes. Los investigadores autorizados utilizan estos datos mediante procedimientos controlados para estudiar el riesgo de enfermedades y la biología. Esto difiere de la estructura de los servicios generales de pruebas genéticas clínicas, donde todos los resultados del análisis se devuelven a cada participante individualmente como un diagnóstico.
A pesar de su gran escala y sus datos longitudinales, presenta sesgos de selección por voluntarios sanos, limitaciones en la representación ancestral y errores fenotípicos en los registros electrónicos de salud (EHR). Es necesaria una validación independiente para generalizar los resultados de la investigación a toda la población y a otros sistemas sanitarios.
100,000 Genomes Project: proyecto centrado en el paciente
El 100,000 Genomes Project reclutó a pacientes con enfermedades raras y cáncer, así como a sus familias, a través de las vías del NHS, conectando la secuenciación del genoma completo con la investigación. El hecho de que se haya completado el objetivo de reclutamiento no significa que todos los análisis, reanálisis y devoluciones de resultados hayan finalizado en el mismo día. Es posible volver a analizar datos anteriores utilizando nuevos conocimientos sobre genes-enfermedad y nuevas canalizaciones (pipelines).
En el cáncer, las muestras tumorales y germinales son clave para la interpretación; en las enfermedades raras, lo son la estructura familiar y el fenotipo. Es más importante contar con muestras adecuadas, datos clínicos y revisiones multidisciplinarias que el simple número de genomas secuenciados.
NHS Genomic Medicine Service: servicio de atención clínica
El Servicio de Medicina Genómica es un servicio sanitario en el que los pacientes solicitan pruebas según las indicaciones y el directorio de pruebas, y reciben los resultados a través de una red de laboratorios designada y su equipo clínico. Es necesario trasladar los descubrimientos de los proyectos de investigación al servicio mediante ensayos estandarizados, sistemas de calidad y vías clínicas.
Para que la genómica se integre en la práctica clínica, deben incluirse la accesibilidad a las pruebas, el tiempo de respuesta, la interpretación de variantes, el asesoramiento genético y las pruebas familiares. El hecho de que un hallazgo significativo en la investigación se convierta automáticamente en un servicio disponible no es automático.
El punto de encuentro de los tres sistemas
La cohorte de investigación apoya la asociación poblacional y el desarrollo de métodos; los proyectos de pacientes prueban el uso de la genómica ante preguntas diagnósticas reales; y el servicio sanitario integra rangos validados en vías estándar. La formación del personal, la infraestructura de datos y los bucles de retroalimentación conectan estos sistemas.
Al mismo tiempo, se deben respetar el consentimiento y la limitación de propósito. Esto no significa que los datos consentidos en un sistema puedan utilizarse sin límites para otros fines.
Preguntas para evaluar los resultados
- ¿Qué pacientes y poblaciones están incluidos o excluidos?
- ¿Cuál es la calidad de los datos fenotípicos y familiares?
- ¿Cuáles son el denominador del rendimiento diagnóstico y las indicaciones de la prueba?
- ¿Cómo se conectan los resultados con cambios reales en la gestión clínica y con la familia?
- ¿Cómo se gestionan el acceso a los datos, el re-consentimiento y la retirada del consentimiento?
- ¿Se mantienen el rendimiento y la accesibilidad en grupos menos representados?
Puntos de confusión frecuentes
- La participación en una cohorte y la realización de una prueba clínica no son lo mismo contractualmente.
- El reclutamiento completado no equivale al final de la investigación o del reanálisis.
- El número de genomas, el número de diagnósticos y la utilidad clínica son indicadores distintos.
- NHS, Genomics England y UK Biobank no son la misma organización.
Límites de la interpretación
La estructura del programa y el directorio de pruebas pueden actualizarse; por lo tanto, se debe consultar la documentación oficial actual. Este texto explica las distinciones de roles dentro del ecosistema y no pretende determinar la elegibilidad para pruebas individuales ni las vías clínicas.
Lectura conectada
La colaboración en investigación poblacional se conecta con Broad MPG, la selección de pruebas, con WGS·WES·panel, y la representación de referencia, con la historia posterior al Human Genome Project hacia el pangenome.