ATAC-seq — 열린 염색질을 직접 본다는 말의 범위
왜 알아야 하는가
ATAC-seq은 Tn5 transposase가 접근하기 쉬운 DNA에 adapter를 삽입한 뒤 fragment를 sequencing해 chromatin accessibility를 추정한다. peak는 “이 구간에서 접근성 신호가 농축됐다”는 뜻이지, 특정 전사인자가 결합했거나 gene이 발현된다는 직접 증거는 아니다. TSS enrichment, FRiP, fragment periodicity, library complexity, mitochondrial reads와 replicate concordance를 함께 보고, single-cell에서는 sparsity·doublet·batch를 추가로 점검한다. QC cutoff는 조직과 protocol에 따라 해석한다.
해석 경계
이 글은 개념과 근거의 범위를 설명하며, 개별 환자의 진단·검사·치료 결정을 제공하지 않습니다.