Antecedentes

La oncogenómica ha experimentado un desarrollo acelerado tras el proyecto de mapeo del genoma del cáncer (TCGA, The Cancer Genome Atlas). En tumores comunes como el cáncer de pulmón o el de mama, la acumulación de grandes volúmenes de datos de pacientes ha permitido que el desarrollo de terapias dirigidas personalizadas se consolide rápidamente. Por otro lado, los cánceres raros y de difícil tratamiento, cuya incidencia es baja, siguen situándose en una zona cieca de la biología molecular. Esto se debe a que, a nivel de un único centro médico, resulta difícil recopilar muestras tisulares suficientes para garantizar la significación estadística. Los proyectos a gran escala existentes han dependido principalmente de un enfoque unidireccional basado en la recolección de restos de muestras quirúrgicas de grandes hospitales de investigación. Los pacientes, sujetos de la investigación, se limitaron a ser meros proveedores de muestras, y existió una ruptura estructural en la que ni siquiera los resultados del análisis genómico se compartían con los propios pacientes. Se perpetuó un círculo vicioso por el cual los pacientes de grupos marginados, que tenían un menor acceso geográfico o menos oportunidades para participar en investigaciones, quedaban excluidos de las cohortes genómicas. Esto actuó como una causa principal que retrasaba el descubrimiento de nuevas dianas terapéuticas para cánceres raros. Contexto que requiere un paradigma de investigación en el que los pacientes participen como socios de la investigación y se les devuelva la información analítica.

Hallazgos clave

La red de Participación de Participantes y Secuenciación del Genoma del Cáncer (PE-CGS, por sus siglas en inglés), establecida bajo el plan Cancer Moonshot del Instituto Nacional del Cáncer de EE. UU. (NCI, por sus siglas en inglés), ha colocado la asociación directa con los pacientes en el centro. El equipo de investigación integró orgánicamente tres unidades especializadas en el ciclo que abarca desde la captación de pacientes y la recolección de muestras hasta el análisis multiómico (multi-omics) y la devolución de resultados. Se puso en marcha la Unidad de Participación del Paciente (PEU, Participant Engagement Unit), en colaboración con grupos de pacientes, para aumentar la comodidad de la participación. La unidad de caracterización del genoma (GCU, Genome Characterization Unit) descifró con precisión el ADN de tejidos tumorales de cánceres raros y células normales mediante los flujos de trabajo de secuenciación del exoma completo (WES, Whole-Exome Sequencing) y de la transcriptómica (RNA-Seq). La unidad de optimización del compromiso (EOU, Engagement Optimization Unit) evaluó cuantitativamente el impacto de los resultados del análisis genómico en la estabilidad psicológica y la toma de decisiones de los pacientes. El avance más destacado fue la creación de un sistema de registro remoto que permite a los pacientes participar recibiendo por correo kits de saliva o sangre directamente desde su lugar de residencia. Se ha asegurado una vía por la que el paciente puede registrarse, independientemente de su área de residencia o de si acude a un gran hospital. Las variantes cuya validez clínica se ha demostrado en los resultados del análisis fueron revalidadas por laboratorios certificados bajo las Enmiendas de Mejora de los Análisis Clínicos (CLIA) y se transmitieron al paciente junto con asesoramiento genético. Logro de compatibilizar, mediante procedimientos institucionalizados, las dos tareas de proteger los derechos e intereses de los pacientes y recopilar datos de alta calidad.

Significado y perspectivas

Los datos construidos por la red PE-CGS se publican secuencialmente en el Sistema de intercambio de datos genómicos (GDC, Genomic Data Commons) del Instituto Nacional de Salud de Estados Unidos (NIH, National Institutes of Health), donde se comparten como un recurso de investigación para investigadores de todo el mundo. Los perfiles acumulados de células germinales y genomas tumorales prometen proporcionar pistas que aceleren la investigación en descubrimiento de dianas y reposicionamiento de fármacos. Se trata de un punto de inflexión ético en la investigación que transforma a los pacientes de sujetos pasivos de observación en colaboradores activos del estudio. También están claros los desafíos prácticos por superar. Deben seguir directrices que reduzcan la confusión y la carga emocional derivada de explicar al paciente las variantes de significado incierto (VUS, por sus siglas en inglés) no clasificadas cuyo significado clínico es poco claro. Asimismo, la obtención de financiación para investigar el mantenimiento a largo plazo de los sistemas de registro remoto y la estandarización del análisis entre laboratorios siguen siendo objeto de verificación continua. Cuando se complementan estas medidas institucionales, la investigación genómica centrada en el paciente se consolida como un motor sostenible para superar las enfermedades raras. Los esfuerzos por completar el mapa genómico de los cánceres menos frecuentes funcionan como un paso firme y práctico que amplía la base de la medicina de precisión pública. Constituyen un puente sólido que amplía las oportunidades de acceso a ensayos clínicos para los pacientes minoritarios que carecían de alternativas terapéuticas.