Un estudio del autismo en personas de ascendencia latinoamericana halla numerosos genes en común con investigaciones centradas en ascendencia europea
La investigación genética del autismo se había centrado en personas de ascendencia europea
Un estudio que analizó datos genéticos de 15.427 personas, incluidos participantes de ascendencia latinoamericana y sus familiares, identificó 35 genes asociados al autismo. De ellos, 19 también mostraron asociaciones significativas en un conjunto de comparación independiente compuesto principalmente por personas de ascendencia europea. Los resultados indican que existen genes en común entre grupos ancestrales que se ven afectados por variantes codificantes raras y perjudiciales asociadas al autismo. No significan que las variantes genéticas sean idénticas en todas las poblaciones.
Los estudios previos de identificación de genes relacionados con el autismo se habían centrado en participantes de ascendencia europea, por lo que había pocos datos para comprobar si sus resultados eran aplicables a otros orígenes genéticos. El consorcio GALA analizó muestras de personas de ascendencia latinoamericana de las Américas para reducir esa brecha. El estudio se publicó en Nature Medicine.
35 genes asociados y coincidencias con el grupo de comparación
La cohorte completa de secuenciación incluyó a 4.717 personas diagnosticadas con trastorno del espectro autista (TEA), además de progenitores, hermanos y participantes de control. Los datos de los progenitores ayudaron a identificar variantes que surgieron de novo en sus hijos; el análisis de carga de variantes que excluyó a los progenitores abarcó a 6.977 personas. Por tanto, no debe interpretarse que las 15.427 personas de la cohorte completa tenían un diagnóstico de autismo.
Los investigadores utilizaron el método TADA, que integra variantes de novo no heredadas de los progenitores, variantes heredadas y datos de casos y controles. Treinta y cinco genes asociados al autismo cumplieron el umbral de una tasa de falsos descubrimientos (FDR) inferior a 0,05, teniendo en cuenta las pruebas múltiples. No todos se descubrieron por primera vez en este estudio: el conjunto incluyó genes ya conocidos y otros para los que sigue acumulándose evidencia de asociación.
Para evitar duplicaciones, los investigadores eliminaron las muestras de ascendencia latinoamericana de los estudios anteriores utilizados para la comparación. En el conjunto resultante de ascendencia no latinoamericana, compuesto principalmente por personas de ascendencia europea, 19 de los 35 genes mostraron señales significativas. También coincidió con estudios anteriores la concentración de señales asociadas al autismo en genes en los que la selección natural mantiene bajas las frecuencias de las variantes que dañan su función.
Respaldo para interpretar pruebas genéticas y brechas pendientes
Los resultados aportan respaldo al uso de investigaciones existentes para interpretar variantes raras asociadas al autismo en personas con diversos orígenes genéticos. Sin embargo, no eliminan las diferencias en la interpretación de los resultados de las pruebas.
Al clasificar con el programa de interpretación de variantes VarSome las variantes de novo en genes asociados al autismo, la proporción de participantes diagnosticados que tenía al menos una variante clasificada como patogénica o probablemente patogénica fue del 4,31 % entre quienes tenían ascendencia latinoamericana y del 5,53 % entre quienes tenían ascendencia no latinoamericana. Son resultados de clasificación de este análisis; no representan la precisión de las pruebas genéticas en general ni su rendimiento diagnóstico total. Los investigadores también señalaron que, como no se tuvieron en cuenta todas las características clínicas de los participantes, estas clasificaciones no deben considerarse evaluaciones que cumplan plenamente las directrices de clasificación de variantes del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG).
El diseño, centrado en datos del exoma, también limitó el análisis preciso del origen ancestral del segmento genómico en el que se encontraba cada variante. La falta de datos sobre frecuencias de variantes en poblaciones específicas y la posibilidad de errores de detección siguen siendo desafíos pendientes. Por ello, los hallazgos respaldan la existencia de características biológicas comunes entre poblaciones, pero no demuestran la eficacia de tratamientos ni la materialización del diseño de tratamientos.
Fuente: Artículo original en Nature Medicine.
Nature Medicine, Published online: March 30, 2026; doi:10.1038/s41591-026-04228-6 Genetic analyses of more than 15,000 individuals across the Americas, including those with autism and their relatives, delineate the genetic profile of autism within Latin American communities and highlight significant genetic overlaps with other ancestries.
El estudio amplía la evidencia que respalda el uso de investigaciones existentes sobre genes asociados al autismo al interpretar los resultados de pruebas genéticas de personas de ascendencia latinoamericana con autismo y sus familias. En los laboratorios, determinar cuán rara es una variante encontrada constituye una parte importante de la interpretación. Si se utiliza únicamente la frecuencia media de la población en su conjunto, una variante relativamente común en un grupo ancestral concreto podría confundirse con una variante rara. Por ello, los investigadores recomiendan consultar también las frecuencias en los subgrupos pertinentes. El estudio señala vías para mejorar los procedimientos de interpretación y los datos de referencia. Como persisten diferencias entre grupos en la clasificación de patogenicidad, la relevancia clínica de cada variante debe evaluarse junto con la información familiar y las características clínicas de la persona.