Antecedentes

El programa de secuenciación rápida del genoma completo (rWGS, por sus siglas en inglés) de Dubái, Little Falcon, influyó en el manejo clínico durante la hospitalización de 53 de 100 niños en estado crítico con sospecha de enfermedad genética. También se identificó la causa genética en el 53%, pero el rendimiento diagnóstico y los cambios en el manejo son resultados distintos.

En cuidados intensivos, las enfermedades genéticas pueden manifestarse con síntomas compartidos por muchas afecciones, como convulsiones o alteraciones metabólicas. Las pruebas secuenciales pueden tardar varias semanas o más en identificar la causa, lo que limita su utilidad para decidir el tratamiento en la fase aguda. En Oriente Medio, la carga de las enfermedades genéticas recesivas es elevada, pero establecer la infraestructura de análisis genómico y disponer de personal especializado han sido obstáculos para su adopción. El equipo de investigación conectó las unidades de cuidados intensivos neonatales y pediátricos de Dubai Health, el sistema público de salud de la ciudad, para evaluar el efecto del diagnóstico rápido en la atención clínica.

Hallazgos principales

El estudio incluyó a 100 niños con sospecha de enfermedad genética para quienes se consideró que un diagnóstico rápido podía ayudar en el manejo agudo. Sesenta y dos fueron derivados desde cuidados intensivos neonatales y 38 desde cuidados intensivos pediátricos; la mediana de edad en el momento de la evaluación fue de 17 días. En 98 casos se analizaron el niño y ambos progenitores; en dos se analizaron el niño y la madre, sin muestra paterna.

Se obtuvo un diagnóstico molecular que explicaba los síntomas principales en 53 niños, con un rendimiento diagnóstico del 53% (intervalo de confianza del 95%: 43,3–62,5%). Entre los pacientes cuyo análisis genómico sugirió una relación de parentesco cercana entre los progenitores, 28 de 35 (80%) recibieron un diagnóstico. Por separado, el rendimiento diagnóstico también fue del 80% en el grupo derivado principalmente para evaluar una posible enfermedad metabólica. Se identificaron diagnósticos moleculares dobles, en los que dos enfermedades genéticas contribuían a los síntomas, en el 5% de la cohorte. Se hallaron múltiples hallazgos moleculares, incluidos hallazgos adicionales no relacionados con la enfermedad principal, en el 12%; estos se distinguen de los diagnósticos dobles.

La mediana del tiempo entre la entrega de la muestra y la comunicación del resultado fue de 81,1 horas, aproximadamente 3,4 días. Los investigadores compararon estos resultados con los de 100 pacientes que recibieron pruebas genéticas estándar antes de la puesta en marcha del programa, entre 2018 y 2022. En el grupo de control histórico, la mediana del tiempo de respuesta fue de 38 días, el rendimiento diagnóstico fue del 30% y la proporción con cambios en el manejo clínico fue del 18%. En el grupo de rWGS, las cifras correspondientes fueron 3,4 días, 53% y 53%.

Los 53 pacientes cuyo manejo cambió incluyeron a 45 que recibieron un diagnóstico molecular y ocho que no lo recibieron. La evaluación abarcó ajustes de medicación o dieta durante la estancia en cuidados intensivos, la reorganización del proceso diagnóstico, decisiones sobre procedimientos o cirugía, derivaciones a especialistas y decisiones de cuidados paliativos. Se notificaron intervenciones farmacológicas o dietéticas en el 36% del total de pacientes, y decisiones relacionadas con procedimientos o cirugía en el 13%; estas categorías podían solaparse.

Los investigadores también comunicaron cambios inmediatos en la evolución de la enfermedad tras los planes de manejo en el 16% de todos los pacientes. Esta cifra comprendía un 8% con resultados favorables registrados y un 8% con decisiones relacionadas con el final de la vida. Esto no significa que se demostrara una mejora de la supervivencia ni que la tasa de éxito del tratamiento fuera del 16%.

Significado y perspectivas

El estudio destaca el valor de un sistema de trabajo que conecta las derivaciones, el asesoramiento genético, la interpretación de variantes y la comunicación de resultados, además de la rapidez de las pruebas. Un equipo multidisciplinario seleccionó conjuntamente a los pacientes para las pruebas y comunicó los resultados al equipo clínico en cuanto terminó el análisis. Los investigadores interpretaron que este sistema respalda la integración de la rWGS en la vía diagnóstica inicial de cuidados intensivos.

Sin embargo, se realizó una comparación con un grupo de control histórico, en lugar de un ensayo aleatorizado con controles contemporáneos, por lo que no es posible atribuir todas las diferencias observadas a la introducción de la prueba. Los resultados de este grupo seleccionado de niños con sospecha de enfermedad genética no pueden extrapolarse directamente a todos los niños en estado crítico. La escasez de datos genómicos de referencia de poblaciones de Oriente Medio también limita la interpretación de variantes. El estudio no demostró directamente una mejora de la supervivencia ni realizó un análisis formal de costo-efectividad; otros sistemas de salud que consideren su adopción deberían evaluar conjuntamente los resultados clínicos y los costos operativos.

La población del estudio, los resultados y el proceso de funcionamiento se describen en el texto completo de acceso público del artículo de Nature Medicine.