Ochre Bio y Lexogen colaboran para crear un conjunto de datos de genómica funcional a gran escala para terapéuticas de enfermedades hepáticas impulsadas por AI

Abordar las limitaciones de los modelos animales existentes y la necesidad de datos biológicos centrados en el ser humano
Históricamente, el desarrollo de fármacos ha dependido en gran medida de modelos animales, como los ratones. Sin embargo, debido a las diferencias biológicas entre especies, las tasas de fracaso en los ensayos clínicos han sido elevadas. Enfermedades complejas como la fibrosis hepática y la esteatohepatitis asociada a la disfunción metabólica (MASH) plantean un desafío significativo, ya que los estudios con animales a menudo no logran predecir con precisión las mejoras clínicas en humanos. Para superar estas limitaciones, existe un énfasis creciente en los conjuntos de datos centrados en humanos, que priorizan el uso de datos genómicos y transcriptómicos derivados de pacientes. Este cambio representa un cambio de paradigma en la industria, con el objetivo de maximizar la predicción clínica y reducir los costes de desarrollo mediante la incorporación de datos humanos reales desde la etapa inicial de generación de hipótesis.
Colaboración de análisis de genes hepáticos a gran escala entre Ochre Bio y Lexogen
Ochre Bio, una empresa de biotecnología con sede en UK, y Lexogen, especialista austriaco en transcriptómica, han establecido con éxito un conjunto de datos de genómica funcional a gran escala para enfermedades hepáticas, utilizando más de 120,000 hepatocitos humanos primarios. En esta colaboración, Lexogen proporcionó su tecnología de perfilado de expresión génica de alta resolución, que no requiere un proceso de extracción, lo que permitió a Ochre Bio adquirir datos de RNA-Seq de alta calidad. La colaboración va más allá de la simple subcontratación de servicios de secuenciación; proporciona datos precisos que pueden ser reconocidos e interpretados inmediatamente por el aprendizaje automático de inteligencia artificial (AI), mejorando significativamente la eficiencia computacional de OBELiX, la plataforma de descubrimiento de dianas de Ochre Bio.
Descubrir relaciones causales e innovar en el descubrimiento de dianas mediante el aprendizaje automático
A diferencia de los datos genómicos tradicionales, que se centran principalmente en identificar correlaciones estadísticas, este conjunto de datos enfatiza el descubrimiento de relaciones causales directas mediante la combinación de experimentos de perturbación génica, como el knockout de genes. Ochre Bio utiliza tejido hepático donado de regiones asiáticas y un sistema de perfusión hepática ex vivo con sede en Nueva York para mantener todo el hígado humano en un estado vital, lo que permite la medición directa de los cambios fisiológicos. Al combinar estos datos experimentales con AI mediante un enfoque de 'lab-in-the-loop', la empresa puede predecir con gran precisión, a partir de un vasto número de genes, las dianas terapéuticas capaces de inducir la expresión del factor de crecimiento de fibroblastos 21 (FGF21), un factor clave para mitigar la fibrosis hepática.
Perspectivas de comercialización en el mercado global de MASH y beneficios derivados de los cambios regulatorios
Tras la aprobación por parte de la FDA (la FDA) en marzo de 2024 de Rezdiffra (resmetirom) de Madrigal Pharmaceuticals como el primer tratamiento MASH, se espera que el mercado mundial de terapias relacionadas crezca rápidamente hasta los $57 mil millones (aproximadamente 78 billones KRW) para 2035. En consonancia con esto, la FDA anunció en abril de 2025 directrices que fomentan el uso de métodos de prueba alternativos, como el modelado computacional y los organoides, y reducen el uso obligatorio de experimentos con animales en el proceso de desarrollo de fármacos, lo que conlleva cambios regulatorios. Ochre Bio, en la etapa preclínica, ha asegurado asociaciones con Boehringer Ingelheim por hasta $1 mil millones y un acuerdo de colicitencia con GSK, demostrando un valor significativo de sus activos de datos exclusivos desde una etapa temprana.
La colaboración de Ochre Bio con Lexogen ha dado como resultado un conjunto de datos de genómica funcional de más de 120,000 células hepáticas, lo que mejora significativamente la fiabilidad computacional del descubrimiento de dianas en la etapa preclínica y aumenta enormemente la productividad de la investigación y el desarrollo en el mercado mundial de la fibrosis hepática, que supera los $20 mil millones anuales. En particular, tras la aprobación de la FDA por parte de la FDA de Rezdiffra, el primer tratamiento MASH, en marzo de 2024, los datos causales derivados de humanos se convertirán en un activo crítico para determinar la tasa de éxito de los estudios preclínicos para los desarrolladores de pipelines competidores posteriores que se dirigen a FGF21 y otras dianas. A medio y largo plazo, con los cambios regulatorios la FDA en abril de 2025 que reconocen oficialmente las pruebas alternativas a los animales, es probable que la tecnología 'lab-in-the-loop' de Ochre Bio se convierta en un protocolo estándar global para la validación de dianas basado en datos biológicos humanos. El hecho de que Ochre Bio ya haya asegurado una asociación de codesarrollo con Boehringer Ingelheim por hasta $1 mil millones y un acuerdo de licencia con GSK demuestra que el valor de la plataforma de datos exclusiva de Ochre Bio ha sido validado exhaustivamente por empresas farmacéuticas globales. Por lo tanto, desde la perspectiva de un inversor, las empresas con generación de datos transcriptómicos e infraestructura de procesamiento de datos de alta calidad probablemente serán reevaluadas como los motores de valor clave de los consorcios de desarrollo de fármacos impulsados por AI.
Fuente: Labiotech (rss)
https://www.labiotech.eu/partner/human-first-datasets-ai-drug-discovery/