NHGRI Identifica cuatro nuevos genes causales para CHD mediante el análisis de NGS en una cohorte africana de CHD
Antecedentes del estudio e importancia del análisis de NGS
Este estudio genético internacional sobre la cardiopatía congénita (CHD), liderado por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI) (NCT01952171), identificó con éxito las causas genéticas de CHD en una población africana genéticamente diversa. Estudios genómicos previos han estado sesgados hacia poblaciones de ascendencia europea (más del 95%%), limitando la aplicación de la medicina de precisión en pacientes africanos. El equipo de investigación colaboró con el Uganda Heart Institute y la Universidad de Lagos para recopilar datos de pacientes africanos, minimizando los factores de confusión ambientales. La introducción de la tecnología de secuenciación de nueva generación (NGS) permitió a los investigadores rastrear variantes clave que causan CHD en el contexto de fondos genéticos complejos, lo cual fue un punto de partida crucial para este estudio.
Diseño clínico específico y resultados diagnósticos
Este estudio implicó el registro de 1,233 pacientes africanos y sus familias, y se llevó a cabo como un estudio observacional a gran escala, el cual finalizó el 22 de 2021. Los resultados mostraron que aproximadamente el 23%% de los sujetos fueron diagnosticados con cardiopatía congénita sindrómica (CHD), que se asociaba con retrasos en el desarrollo o anomalías físicas adicionales. Los fenotipos más comunes observados fueron la Tetralogía de Fallot (20%), Comunicación interventricular (14%) y trasposición de las grandes arterias (8%). En particular, el análisis de secuenciación de exoma de la cohorte nigeriana registró un rendimiento diagnóstico de aproximadamente el 10%%, demostrando una etiología genética significativa.
Identificación de nuevos genes patogénicos y validación funcional
Lo más importante, el logro académico e industrial más significativo de este estudio fue la identificación de cuatro nuevos genes relacionados con CHD mediante validación funcional utilizando un modelo de Drosophila. Los investigadores confirmaron que los genes UBB, EIF4G3, SREBF1 y METTL23 causan defectos críticos durante el desarrollo cardíaco. Esto proporciona pistas cruciales para identificar variantes genéticas específicas de África que anteriormente no habían sido detectadas por los paneles de diagnóstico globales existentes. Es probable que estos cuatro genes se utilicen como biomarcadores para el desarrollo de terapias dirigidas de próxima generación y kits de diagnóstico de alta precisión.
Análisis de impacto industrial y de mercado
El mercado global de tratamiento y gestión de CHD se valora actualmente en aproximadamente entre USD 5.3 mil millones y USD 15.2 mil millones para el año 2025, y se espera que el mercado de NGS alcance hasta USD 15.5 mil millones para el año 2025. Se espera que este estudio contribuya al desarrollo de paneles diagnósticos multiétnicos más integrales por parte de empresas de plataformas de análisis genómico global como Illumina (ILMN) y Thermo Fisher Scientific (TMO), que incluyan poblaciones africanas. En un contexto en el que la demanda de soluciones de medicina de precisión, incluyendo datos multiétnicos, está aumentando rápidamente, esta base de datos genómica será un activo esencial para las estrategias de diversificación de mercado de las empresas de dispositivos de diagnóstico. En última instancia, se espera que acelere la investigación y el desarrollo de biofármacos que se dirigen a las causas fundamentales de CHD.
Se espera que este estudio mejore significativamente la precisión diagnóstica al cerrar la brecha en los datos genómicos específicos de África en el mercado global de NGS, el cual está valorado en USD 15.5 mil millones para 2025. Tras haber completado la fase de estudio observacional clínico (NCT01952171), esta cohorte alcanzó una tasa de diagnóstico genético del 10% en la secuenciación de exomas de pacientes nigerianos e identificó cuatro nuevos genes relacionados con CHD, incluyendo UBB y EIF4G3. Esto ejercerá presión sobre los competidores existentes, como Illumina y Thermo Fisher Scientific, que han estado proporcionando soluciones diagnósticas basadas en datos de origen europeo, para desarrollar procesos de diagnóstico de precisión multiétnicos diferenciados. A medio y largo plazo, servirá como un dato de infraestructura clave para promover el desarrollo de nuevos fármacos que se dirijan a las causas fundamentales de CHD en el mercado global de CHD, el cual se estima en hasta USD 15.2 mil millones para 2025, yendo más allá de los tratamientos estándar para el alivio de síntomas. Por lo tanto, será un referente de inversión a medio y largo plazo para las empresas de biotecnología y de capital de riesgo (VC) que busquen diversificar sus plataformas de diagnóstico y explorar oportunidades de concesión de licencias de biomarcadores específicos.
Fuente: ClinicalTrials.gov (api_ct)