Reverse Complement
DNA 서열 역상보 변환
도구 가이드
정의
DNA 역상보 변환기 — 입력 DNA 서열의 complementary strand(A↔T, G↔C 상보)를 만든 뒤, 방향을 뒤집어(5'→3' reverse) reverse complement strand를 출력합니다. IUPAC ambiguity code(R/Y/S/W/K/M/B/D/H/V/N) 지원.
목적
(1) Reverse primer 설계 — Forward sequence의 reverse complement = reverse primer 후보 (2) Cloning 시 antisense strand 확인 (예: shRNA stem-loop 설계) (3) NGS read mapping에서 antisense strand 확인 (4) gRNA spacer를 sense/antisense 양쪽 확인 (CRISPR design)
사용법
① DNA 서열 입력 (대소문자 무관, 공백·줄바꿈 자동 제거) ② 자동 변환 결과 표시: • Complement (상보 strand, 방향 동일) • Reverse (반전 strand) • Reverse Complement (역상보, 가장 자주 사용) • 길이, GC% 자동 표시 ③ Copy 버튼으로 결과 클립보드 복사 비-DNA 문자 입력 시 경고. IUPAC code(N, R, Y 등)는 그대로 변환.
예시
예 1) Forward primer 5'-ATGGCCAAGGTGGAC-3' → Reverse complement: 5'-GTCCACCTTGGCCAT-3' → 이를 reverse primer로 사용 (Tm 비슷한지 GC/Tm 도구로 검증) 예 2) gRNA target 5'-GAGTCCGAGCAGAAGAAGAA-3' (PAM: NGG 다음) → Reverse complement: 5'-TTCTTCTTCTGCTCGGACTC-3' → antisense strand에서 PAM 확인 시 활용