What is DNA to Protein?

DNA → Protein 6-frame translator — Translates a DNA sequence into protein using all six reading frames (three 5'→3' + three reverse complement) with the standard genetic code. Stop codons shown as * or X.

When should I use DNA to Protein?

(1) Find ORFs (Open Reading Frames) — locate the longest ORF across 6 frames (2) Verify in-frame insertion (e.g., check frameshift after pET vector cloning) (3) Convert Sanger sequencing reads to protein sequence (4) Predict protein candidates from unknown sequence

Can you show me an example of DNA to Protein?

Example) GFP partial sequence 5'-ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG-3' (21 bp) → Frame +1: M-V-S-K-G-E-E (proper start) → Frame +2: W-*-A-R-A-R → Frame +3: G-E-Q-G-R-G → Frames −1, −2, −3: many stops, no ORF → Conclusion: Frame +1 is valid ORF (starts with M)

DNA to Protein

6-frame 서열 번역 (코돈 테이블)

DNA SEQUENCE

Min ORF:aa

도구 가이드

정의

DNA → Protein 6-frame translation 도구 — 입력 DNA 서열을 5'→3' 방향 3개 frame과 reverse complement 3개 frame, 총 6개 frame으로 표준 genetic code에 따라 아미노산 서열로 번역합니다. Stop codon은 * 또는 X로 표기.

목적

(1) ORF(Open Reading Frame) 검색 — 6개 frame 중 가장 긴 ORF 찾기 (2) 클로닝 후 in-frame 확인 (예: pET vector 삽입 후 frame shift 검증) (3) Sequencing 결과(Sanger ABI) → protein sequence 확인 (4) 미지 sequence의 protein 후보 예측

사용법

① DNA 서열 입력 (대소문자 무관, 공백·줄바꿈·숫자 자동 제거) ② 자동 출력: • Frame +1, +2, +3 (forward strand 3 frame) • Frame −1, −2, −3 (reverse complement strand 3 frame) • 각 frame ORF length, longest ORF 강조 표시 ③ Standard codon table 사용 (Met=M, Trp=W, Stop=*) 결과는 1글자 코드로 표시. Mitochondrial/alternative code 미지원.

예시

예) GFP 일부 sequence 5'-ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG-3' (21 bp) → Frame +1: M-V-S-K-G-E-E (정상 start) → Frame +2: W-*-A-R-A-R → Frame +3: G-E-Q-G-R-G → Frame −1, −2, −3: 의미 없는 stop 다발 → 결론: Frame +1이 valid ORF (M으로 시작)