組換えアデノ随伴ウイルス（rAAV）ベクターを用いた遺伝子治療は、遺伝性疾患に対する画期的な治療法として浮上し、前臨床開発段階で高い導入効率と概ね良好な安全性プロファイルを示しました。しかし、血栓性微小血管症、急性呼吸窮迫症候群、肝毒性、心筋炎、サイトカインストーム、血球食細胞性リンパ組織球症などの重篤な有害事象が複数の遺伝子治療臨床試験で観察されています。これらの有害事象を引き起こす毒性の解明に向けた大規模な取り組みが行われ、遺伝子治療を受ける患者に対する臨床ケアはその影響を緩和する方向へ進化しました。これらの毒性は、ウイルスカプシドおよびトランスジーン産物に対する先天的・適応的免疫応答の複雑な相互作用から生じ、既存免疫（抗AAV抗体）によってさらに増幅されることが多いです。免疫調節戦略が開発され、これらの応答に対抗し遺伝子治療の長期的成功を高めています。本レビューは、AAV関連免疫毒性のメカニズム概観と、臨床ケアにおいて報告された症候群および緩和戦略について、遺伝子治療患者を管理する臨床医に提供します。