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Western Blot Densitometry

Western blot 이미지 밴드 정량 (rolling-ball BG)

Intensity = Σ (pixel - BG_rolling_ball) over band ROI

Upload a Western blot image (PNG / JPG / WebP)

도구 가이드

정의

Western blot densitometry 도구 — 업로드한 blot 이미지(PNG/JPG)를 Canvas API로 처리해 (1) 수직 프로파일 valley로 lane 자동 검출 (2) Rolling Ball 알고리즘(radius slider)으로 background 제거 (3) 각 lane의 band ROI 픽셀값 적분으로 intensity 산출. ImageJ Gel Analyzer의 웹 간이버전.

목적

(1) Western blot 결과 정량 (target protein vs loading control 비율) (2) Knockdown/Overexpression 효율 정량 비교 (3) Time-course / dose-dependent 실험 band intensity 추이 (4) ImageJ 설치 어려운 환경에서 빠른 densitometry

사용법

① 이미지 업로드 (PNG / JPG / WebP — 8-bit grayscale 권장, RGB도 자동 변환) ② Lane detection 자동 실행 → 검출된 lane 수 + 위치 표시 • 필요 시 수동 lane 개수 조정 ③ Rolling Ball radius 슬라이더 (10~100 px, 기본 50) → background 제거 ④ Band ROI 자동 설정 (각 lane 최대 강도 영역) — 수동 조정 가능 ⑤ 출력: • Lane별 raw intensity, BG-subtracted intensity • Lane intensity 그래프 (bar chart) • Reference lane(예: GAPDH) 선택해 normalize • CSV export 주의: 노출 과다 saturated band는 정확도 저하. 적정 노출 권장.

예시

예) p-AKT / Total AKT phosphorylation 정량 → 6-lane image upload (Control, 5 / 10 / 30 / 60 / 120 min insulin) → Lane auto-detect (vertical valley) → 6 lanes → Rolling ball radius 50 px → BG 제거 → Lane intensities (raw): 850, 1240, 2150, 3050, 2980, 2710 → Reference (Total AKT) normalize → fold change 1.00, 1.46, 2.53, 3.59, 3.51, 3.19 → 30 min에 peak phosphorylation 확인