What is mendelian-pedigree-sim — 멘델 유전 가상 가계도?

mendelian-pedigree-sim is a free learning tool that lets users drag-and-drop pedigree nodes, toggle 6 inheritance patterns (autosomal dominant/recessive, X-linked dominant/recessive, Y-linked, mitochondrial), auto-compute Punnett squares, run Monte Carlo (n=10,000), and calculate LOD scores (Morton 1955 AJHG 7:277) — all in-house React + SVG. Five learning scenarios (dominant vs recessive / X-linked family / consanguineous marriage risk / BRCA-positive LOD / mitochondrial maternal inheritance) baked in full (Strachan & Read / Morton 1955 / OMIM HBOC, zero npm).

When should I use mendelian-pedigree-sim — 멘델 유전 가상 가계도?

(1) Undergraduate genetics pedigree static figures → drag-and-drop interactive (2) Compare 6 inheritance patterns intuitively (dominant/recessive/X-linked/Y-linked/mitochondrial) (3) Learn Punnett + Monte Carlo law-of-large-numbers ±2% verification (4) LOD score (Morton 1955) clinical genome linkage baseline (5) 5 baked scenarios: consanguineous marriage risk, BRCA positive, mitochondrial maternal, etc. (6) Zero external libs — replace d3-hierarchy / d3-tree with in-house SVG drag

Can you show me an example of mendelian-pedigree-sim — 멘델 유전 가상 가계도?

Example 1) Aa × Aa Punnett → {AA: 0.25, Aa: 0.5, aa: 0.25} Example 2) Monte Carlo n=10,000 (Aa × Aa) → AA ≈ 2500 ±200 / Aa ≈ 5000 ±200 / aa ≈ 2500 ±200 (law of large numbers) Example 3) LOD Morton 1955 (θ=0.1, n=20, r=2) → LOD ≈ 3.197 ±0.01 (strong linkage evidence) Example 4) X-linked recessive (carrier mother × normal father) → 50% affected sons / 0% affected daughters, 50% carriers Example 5) BRCA-positive (autosomal dominant, penetrance 80%) → LOD + 60% next-gen risk Example 6) Mitochondrial maternal → affected mother → all children affected; affected father → 0

mendelian-pedigree-sim — 멘델 유전 가상 가계도Lab

Punnett square + Monte Carlo (n=10K) + LOD score (Morton 1955) + 6 유전 양상 (상우/상열/X우/X열/Y/미토) 가계도 drag-and-drop (외부 lib 0, ko/en/ja).

Punnett + Monte Carlo (n=10K) + LOD = r·log₁₀(θ) + (n−r)·log₁₀(1−θ) + n·log₁₀(2)

LEARNING SCENARIO (5종)

두 보인자 Aa × Aa → 자녀 25% AA, 50% Aa, 25% aa. 우성/열성 형질 발현 비율 비교.

INHERITANCE PATTERN

Dominant/Recessive· Autosomal· X-Linked· Y-Linked· mtDNA

PEDIGREE CANVAS (drag nodes, click ! to toggle affected, × to remove)

☐ male · ◯ female · filled = affected · Bennett 1995 NSGC notation. Select a node first to add spouse/child.

LOD SCORE ANALYSIS (Morton 1955)

θ (recombination)n (meioses)r (recombinants)

LOD ≥ 3 = significant linkage (1000:1 odds). BRCA scenario (θ=0.1, n=20, r=2) → LOD = 3.197 (정정값).

Educational simulator ·

도구 가이드

정의

mendelian-pedigree-sim은 가계도 노드를 drag-and-drop으로 추가 + 6 유전 양상 (상염색체 우성/열성 / X-linked 우성/열성 / Y-linked / 미토콘드리아 모계) 토글 + Punnett square 자동 계산 + Monte Carlo (n=10,000) 무작위 추출 + LOD score (Morton 1955 AJHG 7:277) 계산을 자체 React + SVG로 박제하는 무료 학습 도구입니다. 5 학습 시나리오 (우성 vs 열성 / X-linked 가계 / 친연 결혼 위험률 / BRCA 양성 LOD / 미토콘드리아 모계 유전) baseline 풀세트 (Strachan & Read / Morton 1955 / OMIM HBOC, 외부 npm 0).

목적

(1) 학부 유전학 가계도 정적 도식 → drag-and-drop 인터랙티브 (2) 6 유전 양상 직관 비교 (우성/열성/X-linked/Y-linked/미토콘드리아) (3) Punnett square + Monte Carlo 대수 법칙 ±2% 검증 학습 (4) LOD score (Morton 1955) 임상 유전체 연관 분석 baseline (5) 친연 결혼 위험률 + BRCA 양성 + 미토콘드리아 모계 등 5 시나리오 박제 (6) 외부 lib 0 — d3-hierarchy / d3-tree 대신 자체 SVG drag

사용법

① 가계도 캔버스 — 노드 (○ 여 / □ 남) drag-and-drop 추가 + 자녀/배우자 연결 ② 표현형 toggle (영향 받음 ■ ● / 보인자 / 정상) 클릭 ③ 유전 양상 선택 (6 종) — 상염색체 우성/열성, X-linked 우성/열성, Y-linked, 미토콘드리아 ④ Punnett square 자동 계산 (선택한 부모 쌍 → 자녀 genotype 확률 분포) ⑤ Monte Carlo 무작위 추출 (n=10,000) → 차세대 표현형 분포 표시 (대수 법칙 ±2%) ⑥ LOD score 계산 — recombinant n/r 입력 → LOD = r·log₁₀(θ) + (n−r)·log₁₀(1−θ) + n·log₁₀(2) ⑦ 5 학습 시나리오 빠른 진입 — 우성 vs 열성 / X-linked 가계 / 친연 결혼 / BRCA 양성 / 미토콘드리아 모계 ⑧ 학술 용어 hover (dominant/recessive / autosomal / X-linked / penetrance / expressivity / LOD score / recombination / centimorgan / Punnett 등 16개)

예시

예 1) Aa × Aa Punnett → {AA: 0.25, Aa: 0.5, aa: 0.25} 예 2) Monte Carlo n=10,000 (Aa × Aa) → AA ≈ 2500 ±200 / Aa ≈ 5000 ±200 / aa ≈ 2500 ±200 (대수 법칙) 예 3) LOD Morton 1955 (θ=0.1, n=20, r=2) → LOD ≈ 3.197 ±0.01 (강한 연관 증거) 예 4) X-linked recessive (모친 carrier × 부친 정상) → 남아 50% 발현 / 여아 0% 발현, 50% carrier 예 5) BRCA 양성 가계 (autosomal dominant penetrance 80%) → LOD + 차세대 위험률 60% 예 6) 미토콘드리아 모계 → 모친 영향 시 모든 자녀 영향, 부친 영향 시 자녀 0