Kyte-Doolittle 친수성/소수성 플롯은 아미노산 잔기의 표준 소수성 지수(20 AA 값)를 슬라이딩 윈도우로 평균하여 단백질 1차 서열의 국소 소수성 분포를 시각화하는 도구입니다. 본 구현은 (1) 윈도우 크기 9 / 11 / 19 / 7 라디오 + 사용자 정의(5~21) 입력 (2) GRAVY 별 출력 (3) TM 임계 토글 1.6 default(컨센서스) / 1.75 (Klein 1985) (4) 자동 TM 도메인 탐지 + SVG 보라색 밴드 오버레이를 제공합니다.

(1) 막관통 도메인(TM) 후보 영역 시각 동정 (W=19, ≥1.6 또는 ≥1.75) (2) 신호펩티드 h-region 탐색 (N-term 1-30, W=7) (3) 표면 노출 친수성 루프 / 친수성 코어 위치 추정 (W=9) (4) 분자 전체 GRAVY 지수로 수용성/막단백 분류 (ExPASy ProtParam 호환)

① Protein sequence 입력 (1-letter) ② Window size 선택 • 9 (표면 친수성 / 노출 루프) • 11 (alpha-helix 평가) • 19 (TM 도메인 default) • 7 (신호펩티드 모드) • Custom 5~21 ③ TM 임계 토글: 1.6 (default 컨센서스) / 1.75 (Klein 1985 원본) ④ Load Example: Bacteriorhodopsin (7TM) / Myoglobin (수용성) ⑤ 출력: • GRAVY 별 점수 (전체 평균 hydropathy) • Hydropathy curve (자체 SVG) • 임계 가로선 표시 • TM 후보 영역 보라색 밴드 오버레이 + start/end/avgScore 카드

예 1) Bacteriorhodopsin (W=19, 임계 1.6) → 7개의 뚜렷한 hydropathy 피크 검출 → 7 transmembrane alpha-helix (BR family 정합) 예 2) Myoglobin (W=19, 임계 1.6) → 임계 초과 영역 0개 → 수용성 구형 단백질 분류 예 3) 신호펩티드 모드 (W=7, N-term 1-30) → 분비/표적화 단백질의 h-region 후보 자동 마킹