Binding Kinetics Calculator
kon, koff와 ligand 농도로 KD, kobs, 점유율과 residence time을 계산합니다.
결합 동역학 결과
0보다 큰 유한한 값을 입력하세요.
1:1 단일 단계 가역 결합과 자유 ligand 농도가 일정한 조건을 가정합니다. residence time은 집단 평균이며 개별 complex의 정확한 해리 시점이 아닙니다. Raw sensorgram fitting, ligand depletion, rebinding, mass transport, 다중 결합·협동성은 이 계산기의 범위 밖입니다.
Source: NIH/NCATS Assay Guidance Manual, “Analyzing Kinetic Binding Data” (NBK569501).
도구 가이드
정의
Binding Kinetics Calculator — 1:1 단일 단계 가역 결합에서 결합 속도상수 kon, 해리 속도상수 koff, 자유 ligand 농도로 동역학적 KD, kobs, 평형 점유율, residence time과 반감기를 계산합니다.
목적
(1) SPR/BLI 또는 직접 결합 assay에서 보고된 kon·koff 검산 (2) 후보물질 간 affinity와 dissociation persistence 비교 (3) 특정 ligand 농도에서 평형 점유율·접근 시간 추정 (4) 보고서용 단위 변환과 파생값 정리
사용법
① kon (M⁻¹s⁻¹), koff (s⁻¹), 자유 ligand 농도를 입력합니다. ② KD 농도 단위와 시간 단위를 선택합니다. ③ KD=koff/kon, kobs=kon[L]+koff 및 시간 파생값이 즉시 갱신됩니다. 이 도구는 raw sensorgram을 fitting하지 않습니다. 1:1 model 부적합, ligand depletion, rebinding, mass transport limitation은 별도 분석이 필요합니다.
예시
예) kon=1×10⁶ M⁻¹s⁻¹, koff=0.001 s⁻¹, [L]=10 nM → KD=1 nM, kobs=0.011 s⁻¹, 평형 점유율=90.91% → residence time=16.67 min, 해리 반감기=11.55 min, 결합 반감기=1.05 min