Vector Map Viewer — プラスミド配列 (FASTA/GenBank) を入力すると、円形または直線 plasmid map を描画し、ori, selection marker (AmpR/KanR/PuroR), MCS, promoter (CMV/EF1α/U6), tag (His/FLAG/HA), polyA, restriction site 等を自動 annotation 表示。SnapGene・Benchling の代替。

(1) Cloning strategy 計画時の vector backbone 構造確認 (2) Addgene 等から入手した plasmid の element 位置可視化 (3) Cloning 結果 (例: insert 挿入後) の新規 map 作成 (4) Lab member 間の plasmid 情報共有用 figure 生成

① Sequence 入力 (FASTA / GenBank / SnapGene .dna または raw DNA paste) ② View モード選択 (Circular / Linear) ③ オプション: • 表示する feature 選択 (CDS, promoter, ori, marker など) • カラーテーマ • 表示する restriction enzyme list ④ 出力: • Interactive map (zoom, click → feature 情報) • PNG/SVG export • GenBank file export (現在 coming-soon)

例) pLKO.1-puro (7,052 bp, Addgene #8453) sequence 入力 → Circular map 自動生成 → Annotation: U6 promoter, shRNA MCS (AgeI/EcoRI), PGK promoter, PuroR, ori, AmpR, LTR → AgeI cut site 表示 → shRNA cloning 位置を視覚確認 → PNG export → lab notebook 添付