Binding Kinetics Calculator
kon、koff、ligand濃度から KD、kobs、占有率、residence timeを計算します。
結合動態結果
0より大きい有限値を入力してください。
可逆的な1:1単一段階結合と、遊離 ligand 濃度が実質的に一定である条件を仮定します。Residence time は集団平均であり、各 complex の正確な解離時刻ではありません。Raw sensorgram fitting、ligand depletion、rebinding、mass transport、多部位結合、協同性は対象外です。
Source: NIH/NCATS Assay Guidance Manual, “Analyzing Kinetic Binding Data” (NBK569501).
ツールガイド
定義
Binding Kinetics Calculator — 可逆的な1:1単一段階結合について、kon、koff、遊離 ligand 濃度から動態学的 KD、kobs、平衡占有率、residence time、半減期を計算します。
目的
(1) SPR/BLI・直接結合 assay の kon・koff を検算 (2) 化合物間の affinity と解離持続性を比較 (3) 指定 ligand 濃度での平衡占有率・到達時間を推定 (4) 報告書用の単位換算と派生値を整理
使い方
① kon (M⁻¹s⁻¹)、koff (s⁻¹)、遊離 ligand 濃度を入力します。 ② KD 濃度単位と時間単位を選択します。 ③ KD=koff/kon、kobs=kon[L]+koff、時間派生値が即時更新されます。 Raw sensorgram fitting は行いません。Model 不適合、ligand depletion、rebinding、mass transport limitation は別途解析が必要です。
例
例) kon=1×10⁶ M⁻¹s⁻¹, koff=0.001 s⁻¹, [L]=10 nM → KD=1 nM, kobs=0.011 s⁻¹, 平衡占有率=90.91% → residence time=16.67 min, 解離半減期=11.55 min, 結合半減期=1.05 min