PathMap

Las soluciones de análisis bibliográfico basadas en nube pueden filtrar información confidencial y sufrir semantic drift o alucinaciones. PathMap incorpora «Veridical Enforcement Measures» para mantener el razonamiento del agente en una trayectoria de hechos verificables y seguir únicamente estructuras lógicas presentes en las fuentes.

Implementa el método Swanson's Puzzle para descubrir conexiones entre informaciones académicas aparentemente independientes. El usuario puede explorar relaciones entre genes, sustancias y enfermedades, visualizar genes puente y rutas de interacción, y apoyar estudios de drug repurposing. También puede conectarse a Ollama en localhost:11434 para ejecutar Llama 3 o Phi 3 sin conexión. Se debe validar cada hallazgo con la literatura original y no usar la herramienta sola para diagnóstico.

⚡ Instalación

4-1. Inicio rápido

# No se requiere descarga ni instalación local.
# Abra https://pathmap.org o https://demo.pathmap.org en Chrome, Safari o Edge.

4-2. Configuración RAG privada con LLM local

# 1. Instalar Ollama desde https://ollama.com
# 2. Descargar un modelo open source para PathMap
ollama run llama3

# 3. Abrir https://demo.pathmap.org
# 4. En Settings → API Endpoints, indicar http://localhost:11434
# 5. Ejecutar el análisis bibliográfico sin conexión externa.

🧬 Casos de uso en biociencias

🔬

Descubrimiento de genes asociados a ELA y TDP-43

Analizar literatura de ELA en PathMap conectado a Ollama, mapear relaciones entre agregación/localización de TDP-43 y genes candidatos, y revisar cada vínculo en las fuentes originales.

🧬

Cribado de reposicionamiento mediante Swanson's Puzzle

Aplicar verificación factual a resúmenes de enfermedades motoras y fármacos aprobados para identificar genes puente y priorizar candidatos de reposicionamiento para ensayos.

💊

Mapeo offline de variantes y enfermedades

Comparar datos genómicos de pacientes con cohortes de asociaciones gen-enfermedad en un sandbox local sin exfiltrar datos, generando pistas para investigación que deben validar especialistas.

FAQ

¿Qué es PathMap?

PathMap, publicado por Joshua Dungan el 1 de julio de 2026, es un motor bioinformático AI local-first basado en navegador y una plataforma personal para descubrir conocimiento en literatura. Fue desarrollado para extraer ideas de grandes colecciones de artículos médicos, especialmente sobre enfermedades raras como la ELA. Funciona principalmente en el lado del cliente, permitiendo crear mapas de conocimiento en el navegador sin exponer datos ni depender de costes de servidor. Las soluciones de análisis bibliográfico basadas en nube pueden filtrar información confidencial y sufrir semantic drift o alucinaciones. PathMap incorpora «Veridical Enforcement Measures» para mantener el razonamiento del agente en una trayectoria de hechos verificables y seguir únicamente estructuras lógicas presentes en las fuentes. Implementa el método Swanson's Puzzle para descubrir conexiones entre informaciones académicas aparentemente independientes. El usuario puede explorar relaciones entre genes, sustancias y enfermedades, visualizar genes puente y rutas de interacción, y apoyar estudios de drug repurposing. También puede conectarse a Ollama en localhost:11434 para ejecutar Llama 3 o Phi 3 sin conexión. Se debe validar cada hallazgo con la literatura original y no usar la herramienta sola para diagnóstico.

¿Cuándo debería usar PathMap?

Motor bioinformático AI local-first y plataforma personal de descubrimiento de conocimiento basada en literatura.

¿Cuál es un caso de uso biomédico de PathMap?

Descubrimiento de genes asociados a ELA y TDP-43: Analizar literatura de ELA en PathMap conectado a Ollama, mapear relaciones entre agregación/localización de TDP-43 y genes candidatos, y revisar cada vínculo en las fuentes originales.

BioPlayground

💻 Requisitos del sistema